Bases de biochimie et structure des protéines
-
Bases of chemistry and biochemistry
-
STRUCTURE OF PROTEINS
Protéines à voir (code PDB): ConA ( 1scs ), domaine Fab d'IgG ( 8fab ), complexe IgG-lysozyme ( 1fdl ), superoxide dismutase ( 1abm ), thiorédoxine ( 2trx ), chitinase d'orge ( 1cns , famille 19) et de hévéa ( 2hvm , famille 18), glucanase ( 1ghs ), centre réactionnel photosynthétique ( 1prc ).
Didacticiels de structures protéiques: Molecular Models for Biochemistry (Carnegie-Mellon) dont en particulier un sur la protéine G de Staphylococcus, mais aussi une longue liste de canaux et pompes. Sur Interactive Biochemistry , didacticiels sur la protéase de VIH, le suppresseur de tumeur p53, la protéine kinase C, les cyclooxygénases (et le mode d'action de l'aspirine), les protéines G trimériques de signalisation intracellulaire, etc. Pour ces visualisations, il vous faut installer un plug-in "mdl chime".
Introduction to Protein Structure (Bridgewater, MA).
Myoglobine (Mb) et Hémoglobine (Hb): oxyMb ( 1ltw ), désoxyMb ( 1mbd ), carboxyMb ( 1mcy ), oxyHb ( 2dn1 ), désoxyHb ( 2dn2 ), carboxyHb ( 2dn3 ). Didacticiels sur Mb et Hb (Wellesley), Hb (Amherst), animation de Hb (molmovdb). Site sur les maladies du globule rouge . Plus poussé: Globin Gene Server
-
Hémoglobine et myoglobine
Animation tirée du site Polyview
Structures à voir avec First Glance ou sur Proteopedia:
oxyMb ( 1ltw ), désoxyMb ( 1mbd ), carboxyMb ( 1mcy ), oxyHb ( 2dn1 ), désoxyHb ( 2dn2 ), carboxyHb ( 2dn3 ).
Didacticiels sur Hb (Amherst), animation de Hb (molmovdb). Didacticiels sur Mb et Hb (Wellesley, plus entièrement fonctionnels!),
Site sur les maladies du globule rouge .
Plus poussé: Globin Gene Server.
-
Dynamique des protéines
-
Green Fluorescent Protein
Nobel Price for Chemistry 2008 ! Molécule à la Une in december 2007 (SwissProt)
in plant cells (Hawes, Oxford Brookes), arabidopsis (Haseloff, Cambridge), yeast s (Bloom, North Carolina), animal cells (Lippincott-Schwartz, Bethesda, MD)Image galery of fluorescent plant cells ( The Illuminated Plant Cell )
Image gallery of cells and tissues ( Cell Picture Show)
GFP in art: GFP bunny (Eduardo Kac)
Films et animations
Inner Life of the Cell (musique ou commentaires)
Biologie moléculaire (animations, WEHI Australie)
Bioclips (films et animations diverses)
The ultimate Golgi movie (Hawes, Oxford Brookes)
Programmes de visualisation et Plug-in
Programmes de visualisation en 3-D: First Glance (avec code PDB) ou Jmol (ou Protein Explorer)
Plug-in "mdl chime": MDLChimeSP6.exe pour IE et npchime.dll pour Firefox