Une vingtaine d'étudiants avancés ont entrepris une thèse de doctorat sous la direction des professeurs Hédi Dridi, Matthieu Honegger, Michel Egloff et Denis Knoepfler. En plus de leur recherche personnelle, les étudiants sont vivement encouragés à participer aux cours, séminaires et réunions proposés dans le cadre de l'Ecole doctorale romande en sciences de l'Antiquité.

L'Ecole doctorale romande en sciences de l'Antiquité (EDOCSA) réunit toutes les disciplines en lien avec l'Antiquité (philologie, paléographie, papyrologie, numismatique, épigraphie, histoire ancienne) et l'Archéologie (de la préhistoire au Moyen-Age).

Pour les doctorants en archéologie pré- et protohistorique, des cours, séminaires et colloques peuvent aussi être suivis à l'Ecole européenne de protohistoire de Bibracte.