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Saskia Bindschedler

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Professeure titulaire

Bureau A215

Tel: +41 32 718 22 52

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Intérêts en recherche

 

D’une manière générale, je suis intéressée par les interactions microbiennes au sein des écosystèmes et comment cela affecte leur environnement abiotique. En se concentrant sur les sols en tant que modèles d’interfaces minérales-biologiques, j’essaie de comprendre comment les interactions entre bactéries et champignons ont un impact sur les cycles biogéochimiques, et ceci à différentes échelles. J’ai choisis de me concentrer à la fois sur ces deux groupes de microorganismes, car les deux présentent une multitude d’adaptations à leur environnement. Dans mes recherches actuelles, j’étudie les interactions champignons-bactéries dans deux systèmes différents: l'exploitation minière urbaine et la voie oxalate-carbonate (OCP). 1) Les métaux sont des ressources non renouvelables que les micro-organismes sont capables de mobiliser et d'immobiliser sous différentes formes. Ces capacités peuvent être exploitées afin de modifier la (bio) disponibilité de métaux sélectionnés pour des projets de recherche appliquée (par exemple, la bioremédiation, la biorécupération). 2) L'OCP est un processus décrit à partir de sols tropicaux et reconnu pour son importance dans les cycles biogéochimiques du carbone et du calcium. Ses principaux acteurs biologiques sont les plantes, les champignons et les bactéries. Par conséquent, l'OCP est un modèle idéal pour étudier les interactions microbiennes et leurs effets sur les cycles biogéochimiques, tout en travaillant à plusieurs échelles d'écosystème.

 

Curriculum académique

  • Depuis août 2014: Maître de conférences en (géo-) mycologie

Enseignement: Mycologie pour les étudiants en licence et plusieurs conférences dans le Master en Biogéosciences. Domaines de recherche: Rôle des champignons dans le fonctionnement des sols, services écosystémiques des interactions bactéries-champignons, microorganismes et métaux / minéraux.

 

  •     Octobre 2013 - juillet 2014: boursier post-doctoral FNS (Advanced Postdoc Mobility)

Laboratoire de microbiologie, groupe Université de Neuchâtel et géobiologie, IMPMC, UPMC, Paris.
Domaine de recherche: Importance des autoroutes fongiques dans le fonctionnement du sol: la voie oxalate-carbonate en tant que système modèle d’interactions microbiennes.

 

  •     Mars 2012 - août 2013: boursier post-doctoral du FNS (bourse de recherche de futurs chercheurs)

Groupe de biodisponibilité, Département de microbiologie environnementale, Centre Helmholtz pour la recherche environnementale - UFZ, Leipzig.
Domaine de recherche: Influence des autoroutes fongiques sur l’efficacité de la «voie oxalate-carbonate» dans des environnements non saturés.

 

  •     Mai 2011 - février 2012: assistant post-doctoral

Laboratoire de Microbiologie, Université de Neuchâtel.
Participation à des conférences et à des travaux dirigés du laboratoire.
Domaine de recherche: Aspects écologiques de la dispersion des bactéries par les hyphes fongiques dans les sols.

 

  •     Novembre 2006 - avril 2011: thèse de doctorat en sciences de l'environnement

Institut de géologie et paléontologie, Université de Lausanne.
Participation aux travaux dirigés sur le terrain et en laboratoire de l'institut, assistant à la bibliothèque des sciences de la Terre.
Titre de la thèse: «Le rôle des champignons dans la précipitation de la calcite. Relations entre les filaments fongiques, les nanofibres et la calcite à fibres à aiguilles ». Financé par le FNS.

 

  •     2005-2006: Master of Science en biogéosciences

Université de Neuchâtel
Titre de la thèse: «Caractérisation et fonctionnalités des communautés fongiques et bactériennes dans les sols organiques développées sur un écosystème de talus d'éboulis froids. Creux du Van / NE », Laboratoire de Microbiologie et Laboratoire Sol et Végétation (Unine).

 

  •     2001-2005: Baccalauréat en sciences pluridisciplinaire en sciences de la nature

Université de Neuchâtel

 

Communication dans les médias

RTS avis d' experts

 

Publications

 

  • Bindschedler S, Bouquet Vu T, Job D, Joseph E, Junier P. 2017. Fungal biorecovery of gold from e-waste. In: Sariaslani S, Gadd GM (eds), Advances in Applied Microbiology 99, p. 53-81.

 

  • Filippidou S, Bindschedler S, Jeanneret N, Junier P. 2017. Bacterial diversity in the sulfur and iron springs at Ponts-de-Martel, Neuchâtel. Bulletin de la Société Neuchâteloise des Sciences Naturelles 136, 37-49.

 

  • Comensoli L, Bindschedler S, Junier P, Joseph E. 2017. Iron and fungal physiology: A review of biotechnological opportunities. In: Sariaslani S, Gadd GM (eds), Advances in Applied Microbiology 98, p. 31-60.

 

  • Joseph E, Bindschedler S, Albini M, Comensoli L, Kooli W, Mathys L. 2017. Microorganisms for safeguarding cultural heritage. In: Dighton J, White JF (eds), The fungal community: its organization and role in the ecosystem, 4th edition, CRC Press, Boca Raton FL, p. 509-517.

 

  • Bindschedler S, Cailleau G, Verrecchia E. 2016. Role of Fungi in the Biomineralization of Calcite. Minerals 6 (2): 41.

 

  • Hervé V, Junier T, Bindschedler S, Verrecchia E, Junier P. 2016. Diversity and ecology of oxalotrophic bacteria. World Journal of Microbiology & Biotechnology 32 (2): 28.

 

  • Simon A, Bindschedler S, Job D, Wick LY, Filippidou S, Kooli WM, Verrecchia EP, Junier P. 2015. Exploiting the fungal highway: development of a novel tool for the in situ isolation of bacteria migrating along fungal mycelium. FEMS Microbiology Ecology 91 (11): fiv116.

 

  • Hasinger O, Spangenberg JE, Millière L, Bindschedler S, Cailleau G, Verrecchia EP. 2015. Carbon dioxide in scree slope deposits: A pathway from atmosphere to pedogenic carbonate. Geoderma 247-248: 129-139.

 

  • Bindschedler S, Braissant O, Cailleau G, Millière L, Job D, Verrecchia EP. 2014. Unravelling the enigmatic origin of calcitic nanofibres in soils and caves: purely physicochemical or biogenic processes? Biogeosciences 11: 2809-2825.

 

  • Cailleau G, Mota M, Bindschedler S, Junier P, Verrecchia EP. 2013. Detection of active oxalate-carbonate pathway ecosystems in the Amazon Basin: global implications of such natural potential C sink. Catena 116: 132-141.

 

  • Bravo D, Cailleau G, Bindschedler S, Simon A, Job D, Verrecchia EP, Junier P. 2013. Isolation of oxalotrophic bacteria able to disperse on fungal mycelium. FEMS Microbiology Letters 348: 157-166.

 

  • Pion M, Spangenberg JE, Simon A, Bindschedler S, Job D, Junier P. 2013. Bacterial farming by the fungus Morchella crassipes. Proceedings of the Royal Society B 280 (1773).

 

  • Pion M, Bshary R, Bindschedler S, Filippidou S, Wick LY, Job D, Junier P. 2013. Gains of bacterial flagellar motility in a fungal world. Applied and Environmental Microbiology 79 (22): 6862-6867.

 

  • Braissant O, Bindschedler S, Daniels AU, Verrecchia EP, Cailleau G. 2012. Microbiological activities in moonmilk monitored using isothermal microcalorimetry (Cave of «Vers chez le Brandt», Neuchâtel, Switzerland). Journal of Cave and Karst Studies 74 (1): 116-126.

 

  • Bindschedler S, Millière L, Cailleau G, Job D, Verrecchia EP. 2012. An ultrastructural approach to analogies between fungal structures and needle fibre calcite. Geomicrobiology Journal 29 (4): 301-313.

 

  • Millière L, Spangenberg J, Bindschedler S, Cailleau G, Verrecchia EP. 2011. Reliability of stable carbon and oxygen isotope composition of pedogenic needle fibre calcite as environmental indicators: examples from Western Europe. Isotopes in Environmental & Health Studies 47 (3): 341-358.

 

  • Millière L, Hasinger O, Bindschedler S, Cailleau G, Spangenberg JE, Verrecchia EP. 2011. Stable carbon and oxygen isotopic signatures of pedogenic needle fibre calcite. Geoderma 161, 74-87.

 

  • Bindschedler S, Millière L, Cailleau G, Job D, Verrecchia EP. 2010. Calcitic nanofibres in soils and caves: a putative fungal contribution to carbonatogenesis. Tufas and Speleothems: Unravelling the Microbial and Physical Controls. Geological Society, London, Special Publications 336, 225-238.

 

Published conference Abstracts

 

  • Braissant O, Bindschedler S, Cailleau G, Aubrecht R, Kovacic L, Lee N. 2010. Isothermal microcalorimetry a novel tool for non-disruptive analysis of microbial heat production in subsurface ecosystems. Origins of life and evolution of biospheres 40, 561-562.

 

  • Bindschedler S, Millière L, Cailleau G, Job D, Verrecchia EP. 2009. Fungal implication in secondary calcium carbonate accumulation in soils and caves. Geochimica Cosmochimica Acta 73(13), A123.

 

  • Millière L, Hasinger O, Bindschedler S, Cailleau G, Spangenberg J, Verrecchia EP. 2009. Tracing soil carbon cycle and the origin of needle fibre calcite. Geochimica Cosmochimica Acta 73(13), A882.